Далеко на севере лагерь эскимосов-кочевников находится под угрозой голода и вымирания. Шаман племени, Крулик, не в силах помочь, и людей охватывает отчаяние.

Во второй части отряд «G.I. Joe» вновь объявит вызов группировке «Кобра» и вступит в противостояние с правительством…

Человечество развивалось и процветало до того момента, когда из глубин океанов не появились огромных размеров чудовища, их назвали "Кайдзу". В этой войне счет жертв должен был исчисляться миллионами жизней за несколько лет практически уничтожить человечество. Для противодействия чудовищам были созданы специальные огромные роботы, которых именуют как "Джагеры".

Во второй части отряд «G.I. Joe» вновь объявит вызов группировке «Кобра» и вступит в противостояние с правительством…

Юный оружейник Бэлиан вынужден бежать со своей родины. Он присоединяется к отряду крестоносцев, которым руководит его отец. Но, в одной из битв, отец получает тяжелую рану и перед смертью присваивает своему сыну сан рыцаря, и тот клянется в верности королю Иерусалима.